From functional genomics to systems biology : concepts and practices [in] Comptes rendus. Biologies, 2003, 326, 10-11 - http://www.sciencedirect.com (2008-01-19)
Modélisation de l'expression génétique bactérienne dans un pi-calcul stochastique à objets concurrents / C. Kuttler, 2007 (p. IV) [thèse] - http://tel.archives-ouvertes.fr (2008-01-19)
Biologie systémique : standards et modèles, 2007
Biologie systémique
Bioinformatique
Biologie moléculaire
Génétique
Modèles mathématiques
Systèmes biologiques
Méthodes de satisfiabilité hybrides pour l'inférence de régulations booléennes contrôlant des réseaux métaboliques / Kerian Thuillier ; sous la direction de Anne Siegel et de Loïc Paulevé / , 2024
Modélisation bioinformatique des réseaux de régulation génétique et métabolique : application à l'étude du comportement des cellules exposées au déficit en folates et à des contaminants alimentaires en cause dans la génèse du cancer / Etienne Gnimpieba Zohim ; sous la direction d'Abalo Chango et Damien Eveillard / [S.l.] : [s.n.] , 2011
Modélisation incrémentale des réseaux biologiques / Anastasia Yartseva Smidtas ; sous la direction de Hanna Klaudel et de François Képès / Lille : Atelier national de reproduction des thèses , 2007
Population biology and criticality : from critical birth-death processes to self-organized criticality in mutation pathogen systems / Nico Stollenwerk, Vincent Jansen / London : Imperial College Press , cop. 2011
Caractérisation de la biologie des systèmes au sein de mécanismes de régulation complexes dans des cellules cancéreuses : quantification des interactions moléculaires pour la conception et optimisation de thérapies / Gabriel Jimenez Dominguez ; sous la direction de Jacques Colinge / , 2021
Causes and consequences of physiological constraints on evolutionary models : new insights on the evolution of ageing and heredity / Grégory Paul ; sous la direction de François Taddeï / [S.l.] : [s.n.] , 2007
Comprendre l’adaptation de Lactococcus lactis par une approche de biologie intégrative à l’échelle du génome / Clémentine Dressaire ; [sous la direction de] Muriel Cocaign- Bousquet / [Toulouse] : [s.n.] , 2009
Bases creuses en algèbre linéaire exacte et simplification algorithmique de modèles biologiques / Alexandre Temperville ; sous la direction de François Boulier et de François Lemaire / , 2016
La construction du réseau de régulation transcriptionnelle / Islam Sultan ; sous la direction de Sophie Schbath et de Pierre Nicolas / , 2019
Handbook of statistical systems biology / edited by Michael P. H. Stumpf, David J. Balding, Mark Girolami / Chichester : Wiley , 2011
Étude interdisciplinaire des systèmes vivants coopératifs : caractérisation de nouvelles formes de communications : aux frontières du vivant / par Babak Nichabouri ; [sous la direction du Pr Jean-Louis Laplanche] / [Lieu de publication inconnu] : [éditeur inconnu] , 2016
Advances in statistical bioinformatics : models and integrative inference for high-throughput data / edited by Kim-Anh Do, Zhaohui Steve Qin, Marina Vannucci / Cambridge : Cambridge university press , 2013
Transmission d'informations par perturbations dynamiques dans les réseaux métaboliques / Arthur Lequertier ; sous la direction de Wolfram Liebermeister et de Alberto Tonda / , 2025
Biologie systémique : standards et modèles / ECRIN, Échange et coordination recherche-industrie ; sous la direction de Magali Roux / Sophia-Antipolis : Omniscience , DL 2007
Comparative study of the proteome of S. coelicolor M145 and S. lividans TK24, two phylogenetically closely related strains with very different abilities to accumulate TAG and produce antibiotics / Aarón Millán Oropeza ; sous la direction de Marie-Joëlle Virolle / , 2017
Apprentissage de données génomiques multiples pour le diagnostic et le pronostic du cancer / Matahi Moarii ; sous la direction de Jean-Philippe Vert et de Fabien Reyal / , 2015
Systems biology : philosophical foundations / edited by Fred C. Boogerd and Frank J. Bruggeman,... Jan-Hendrick S. Hofmeyr,... [et al.] / Amsterdam : Elsevier , cop. 2007
Hyperbolic and kinetic models for self-organised biological aggregations : a modelling and pattern formation approach / Raluca Eftimie / Cham : Springer
An Introduction to systems biology : design principles of biological circuits / Uri Alon / Second edition / Boca Raton (Fl.) : CRC Press
Kinetic modelling in systems biology / Oleg Demin, Igor Goryanin / Boca Raton : A Chapman & Hall , cop. 2009
Analyses et prédictions bioinformatiques de réseaux d'interactions protéine-protéines contextualisés / Oussema Souiai ; sous la direction de Christine Brun / [S.l.] : [s.n.] , 2011
Étude de l'évolution des interactions moléculaires chez les Eucaryotes par des méthodes de comparaison de réseaux dans le but d'identifier des processus ancestraux partagés associés au vieillissement / Hugo Bonnefous ; sous la direction de Éric Bapteste et de François-Joseph Lapointe / , 2025
German Medical Data Sciences 2022 : future medicine: more precise, more Integrative, more sustainable : proceedings of the Joint Conference of the 67th Annual Meeting of the German Association of Medical Informatics, Biometry, and Epidemiology e.V. (gmds) and the 14th Annual Meeting of the TMF -- Technology, Methods, and Infrastructure for Networked Medical for Networked Medical Research e.V. 2022 online in Kiel, Germany / edited by Rainer Röhrig,... Niels Grabe,... Verena S. Hoffmann,...[et al.] / Amsterdam, [etc.] : IOS Press
Systems biology : a very short introduction / Eberhard O. Voit / Oxford : Oxford university press , 2020
A first course in systems biology / Eberhard O. Voit / Third edition / New York : CRC Press
Étude des réseaux biologiques à grande échelle par modélisation statique et résolution des contraintes / Carito Guziolowski ; [sous la dir. de] Anne Siegel / [S.l.] : [s.n.] , 2010
Analyse de réseaux de régulation par approches de coloration de graphes dans le cadre du myélome multiple / Bertrand Miannay ; sous la direction de Olivier Henri Roux et de Carito Guziolowski et de Stéphane Minvielle / , 2017
Machine learning and systems biology approaches to find therapeutic strategies in atip3-deficient triple negative breast cancer / Gwenn Guichaoua ; sous la direction de Véronique Stoven et de Chloé-Agathe Azencott / , 2025
Logic programs to infer computational models of human embryonic development / Mathieu Bolteau ; sous la direction de Jérémie Bourdon et de Carito Guziolowski / , 2024
German Medical Data Sciences 2023 : close to people : proceedings of the 68th annual meeting of the German Association of Medical Informatics, Biometry, and Epidemeiology e.V. (gmds) 2023 in Heilbronn, Germany / edited by Rainer Röhrig,... Niels Grabe,... Martin Haag,...[et al.] / Amsterdam, [etc.] : IOS Press
Allocation optimale de ressources dans la croissance bactérienne : étude théorique et applications à la production de métabolites / Agustín Gabriel Yabo ; sous la direction de Jean-Luc Gouzé et de Jean-Baptiste Caillau / , 2021
Algorithmes pour la prédiction de stratégies de reprogrammation cellulaire dans les réseaux Booléens. / Hugues Mandon ; sous la direction de Stefan Haar / , 2019
Enjeux philosophiques de la biologie des systèmes / Pierre-Alain Braillard ; sous la direction de Jean Gayon / , 2008
German medical data sciences : shaping change-creative solutions for innovative medicine : proceedings of the 64th annual meeting of the German Association of Medical Informatics, Biometry and Epidemiology (gmds e.V.) 2019 in Dortmund, Germany - GMDS 2019 / edited by Rainer Röhrig,... Harald Binder,... Hans-Ulrich Prokosch,... [et al.] / Amsterdam [etc.] : IOS Press
Modèles réduits et hybrides de réseaux de réactions biochimiques : applications à la modélisation du cycle cellulaire / Vincent Noël ; [sous la dir. de] Ovidiu Radulescu, Nathalie Théret / [S.l.] : [s.n.] , 2012
Caractérisation de la diversité du répertoire TCR par modélisation de données de séquençage haut-débit / Wahiba Chaara ; sous la direction de Pierre-André Cazenave et de Adrien Six / , 2016
Essential computing skills for biologists / Ziling Wang, Lishu Zhang / Beijing : Higher Education Press Limited Company
Analyse multi-niveaux en biologie systémique computationnelle : le cas des cellules HeLa sous traitement apoptotique / Matthieu Pichené ; sous la direction de Blaise Genest / , 2018
Pertinence des méthodes vaccinales actuelles vis-à-vis de l'immunosénescence et nouvelles stratégies développées / Marc Devarieux ; directrice de thèse Madame le Professeur Maria Mamani-Matsuda / , 2020
Biologie des systèmes et intelligence artificielle pour l'identification des réseaux de régulation de l'addiction oncogénique dans le cancer du poumon / Geoffrey Pawlak ; sous la direction de Mohamed Elati et de David Tulasne / , 2025
MIM-Logic : a logic for reasoning about molecular interaction maps / Naji Obeid ; directeur de thèse, Luis Fariñas Del Cerro / Toulouse : Université Paul Sabatier, Toulouse 3 , 2015
Understanding responses to external stimuli using network-based approaches / Konrad Frederik Gwinner ; sous la direction de Heribert Hirt et de Benno Schwikowski / , 2014
Simplifications exactes et structurelles de réseaux de réactions biologiques / Guillaume Madelaine ; sous la direction de Cédric Lhoussaine et de Joachim Niehren / , 2017
Data mining for systems biology : methods and protocols / edited by Hiroshi Mamitsuka,... / Second edition / New York : Humana Press
Algorithmic information dynamics : a computational approach to causality with applications to living systems / Hector Zenil,... Narsis A. Kiani,... Jesper Tegnér,... / Cambridge : Cambridge University Press , 2023
Approches symboliques de la modélisation et de l'analyse des systèmes biologiques / sous la direction de Cédric Lhoussaine et Elisabeth Remy / Londres : Iste éditions , 2022
Systems biology in practice : concepts, implementation and application / E. Klipp ... [et al.] / Weinheim : Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA
Approches symboliques de la modélisation et de l'analyse des systèmes biologiques / sous la direction de Cédric Lhoussaine et Elisabeth Remy / London : ISTE Editions , 2022
Modèles et méthodes pour l'évolution biologique / sous la direction de Gilles Didier, Stéphane Guindon ; [Guillaume Achaz, Samuel Alizon, Frédéric Austerlitz et al.] / Londres : Iste éditions , 2022
Prédiction de la structure de contrôle de bactéries par optimisation sous incertitude / Marouane Ait El Faqir ; sous la direction de Gérard Scorletti / , 2016
Encyclopedia of systems biology / edited by Werner Dubitzky, Olaf Wolkenhauer, Kwang-Hyun Cho, Hiroki Yokota / New York, NY : Springer
Systems genetics : linking genotypes and phenotypes / edited by Florian Markowetz,... Michael Boutros,... / Cambridge : Cambridge University Press , 2015
Rôle du régulateur post-transcriptionnel CSR dans l'adaptation métabolique de la bactérie modèle Escherichia coli / Manon Morin ; sous la direction de Muriel Cocaign-Bousquet et de Delphine Ropers / Toulouse : INSA , 2015
Inférence logique de réseaux booléens à partir de connaissances et d'observations de processus de différenciation cellulaire / Stéphanie Chevalier ; sous la direction de Christine Froidevaux et de Loïc Paulevé / , 2022
Evolving information in living systems : a pathway for the understanding of cooperation and other major transitions / Livio Riboli-Sasco ; sous la direction de François Taddéi / Lille : Atelier national de reproduction des thèses , 2010
Model Building by Temporal Logic Constraint Solving : Investigation of the Coupling between the Cell Cycle and the Circadian Clock / Pauline Traynard ; sous la direction de François Fages et Denis Thieffry / Lille : Atelier national de reproduction des thèses , 2016
Deep characterization of the Modified Vaccinia Ankara vaccine induced B cell response in the context of prime-boost immunization / Andre Rodriguez Pozo ; sous la direction de Anne-Sophie Beignon / , 2019
Analyses et prédictions bioinformatiques de réseaux d'interactions protéine-protéines contextualisés / Oussema Souiai ; sous la direction de Christine Brun / , 2011
Memorized Discrete Systems and Time-delay / by Albert C. J. Luo. / Cham : Springer International Publishing Switzerland
Philosophie et cellules souches : Le futur antérieur au coeur de la médecine régénératrice / Benoît Elichabe ; sous la direction de Alain Leplège et Claude Debru / Lille : Atelier national de reproduction des thèses, Université de Lille III , [2017]
Engineering and analyzing multicellular systems : methods and protocols / edited by Lianhong Sun,..., Wenying Shou,... / New York : Humana Press , cop. 2014
Proceedings of the Évry Spring school on advances in systems and synthetic biology, March 24th-28th, 2014 / edited by Patrick Amar, François Képès, Vic Norris / 13th ed. / [Les Ulis] : [EDP sciences] , DL 2014
Découverte et exploration des modules conservés de transformations chimiques dans le métabolisme / Maria Sorokina ; sous la direction de Claudine Médigue et de David Vallenet / , 2016
Développement de méthodologies de reconstruction et d'analyse des réseaux de signalisation de protéines impliquées dans le cancer à partir de données phosphoprotéomiques par approches de la biologie systémique / Marion Buffard ; sous la direction de Peter Coopman et de Ovidiu Radulescu / , 2021
Application de la biologie des systèmes pour l'identification de marqueurs moléculaires des maladies rénales dans les fluides biologiques / Franck Boizard ; sous la direction de Joost-Peter Schanstra et de Olivier Teste / Toulouse : Université Toulouse 3 , 2019
Modélisation probabiliste en biologie cellulaire et moléculaire / Romain Yvinec ; sous la direction de Mostafa Adimy et de Michael C Mackey et de Laurent Pujo-Menjouet / , 2012
Systems biology : a textbook / Edda Kilpp, Wolfram Liebermeister, Christoph Wierling... [et al.] / Second, completely revised and enlarged edition / Weinheim : Wiley-VCH
Modèles réduits et hybrides de réseaux de réactions biochimiques : applications à la modélisation du cycle cellulaire / Vincent Noël ; [sous la dir. de] Ovidiu Radulescu, Nathalie Théret
Caractérisation du métabolisme de Eubacterium limosum par une approche quantitative de biologie des systèmes / Guillaume Pregnon ; sous la direction de Philippe Soucaille / , 2022
Systems biology : functional strategies of living organisms / Leszek Konieczny, Irena Roterman-Konieczna, Pawel Spolnik / New York ; Heidelberg : Springer , cop. 2014
Biologie : l'ère numérique / sous la direction de Magali Roux ; préface de Pierre Tambourin et Françoise Russo-Marie / Paris : CNRS éd. , DL 2009
Modélisation mathématique de la dégradation des ARNm bactériens et intégration de données omiques / Thibault Étienne ; sous la direction de Delphine Ropers et de Muriel Cocaign-Bousquet / , 2020
Comprendre l’adaptation de Lactococcus lactis par une approche de biologie intégrative à l’échelle du génome / Clémentine Dressaire ; [sous la direction de] Muriel Cocaign- Bousquet / Toulouse : INSA , 2009
MIM-Logic : a logic for reasoning about molecular interaction maps / Naji Obeid ; directeur de thèse, Luis Fariñas Del Cerro / [S.l.] : [s.n.] , 2014
Étude du rôle des NTIC sur la construction de connaissances scientifiques dans le domaine de la biologie : implication pour la didactique de la biologie en contexte numérique / Dorsaf Ben Ismail Ben Romdhane ; sous la direction de Denis Legros / [S.l.] : [s.n.] , 2011
From systems biology to systems medicine / James A. Marcum / New York (N.Y.) : Nova Science Publishers
Discrete event modeling and analysis for systems biology models / Hayssam Soueidan ; sous la direction de David James Sherman et de Grégoire Sutre et de Macha Nikolski / , 2009
Unsupervised hierarchical deconvolution of gene expression data to unravel the tumor micro-environment complexity / Nicolas Sompairac ; sous la direction de Andrei Zinovyev et de Inna Kuperstein / , 2021
Modélisation dynamique de la signalisation cellulaire : aspects différentiels et discrets : application à la signalisation du facteur de croissance TGF-β dans le cancer / Goeffroy Andrieux ; sous la direction de Nathalie Théret et de Michel Le Borgne / , 2013
Plant systems biology / edited by Dr. Dmitry A. Belostotsky,... / New York (NY) : Humana press , cop. 2009
Approche combinée expérimentale et mathématique pour la personnalisation sur base moléculaire des thérapies anticancéreuses standards et chronomodulées / Annabelle Ballesta ; sous la direction de Francis Lévi et de Jean Clairambault / , 2011
Analyse de l'émergence de Salmonella Senftenberg dans les productions avicoles / Zineb Boumart ; sous la direction de Philippe Velge / , 2012
Modélisation cinétique du métabolisme : construction du modèle, analyse et applications biotechnologiques = = Kinetic models of metabolism : model construction, model analysis and biotechnological applications / Adrien Henry / Villeurbanne : [CCSD] , 2016
Systems Biology Volume 1, integrative biology and simulation tools / Aleš Prokop, Béla Csukás, editors / Dordrecht : Springer Netherlands
New horizons in predictive drug metabolism and pharmacokinetics / edited by Alan G. E. Wilson,... / Cambridge : Royal Society of Chemistry , cop. 2016
Plant systems biology : methods and protocols / edited by Mikaël Lucas / Second edition / New York, NY : Humana Press
Une approche bioinformatique intégrative pour la recherche de cibles physiopathologiques dans les maladies complexes : une application aux données transcriptomiques / Edi Prifti ; sous la direction de Jean-Daniel Zucker / Lille : Atelier national de reproduction des thèses , 2011
A practical guide to cancer systems biology / edited by Hsueh-Fen Juan,... Hsuan-Cheng Huang,... / Singapore : World Scientific Publishing
Philosophy of systems biology : perspectives from scientists and philosophers / Sara Green, editor / Cham : Springer , C 2017
Mesures quasi-stationnaires et applications à la modélisation de l'évolution biologique / Aurélien Velleret ; sous la direction de Etienne Pardoux et de Michael Kopp / , 2020
Enjeux philosophiques de la biologie des systèmes / par Pierre-Alain Braillard ; sous la direction de Jean Gayon,..., et Michel Morange,... / Lille : Atelier national de Reproduction des Thèses , 2009
Méthodes pour l'identification des modèles de réseaux biochimiques / Sara Berthoumieux ; sous la direction de Hidde de Jong et de Daniel Kahn / , 2012
Modèles et méthodes pour l'évolution biologique / sous la direction de Gilles Didier, Stéphane Guindon ; [Guillaume Achaz, Samuel Alizon, Frédéric Austerlitz et al.] / London : ISTE Editions , 2022
Systems biology and bioinformatics : a computational approach / Kayvan Najarian, Siamak Najarian, Shahriar Gharibzadeh... [et al.] / Boca Raton : CRC press , cop. 2009
Modélisation incrémentale des réseaux biologiques / Anastasia Yartseva Smidtas ; sous la direction de Hanna Klaudel et de François Képès / , 2007
Étude exhaustive de voies de signalisation de grande taille par clustering des trajectoires et caractérisation par analyse sémantique / Jean Coquet ; sous la direction de Olivier Dameron et de Nathalie Théret / , 2017
Étude du rôle des NTIC sur la construction de connaissances scientifiques dans le domaine de la biologie : implication pour la didactique de la biologie en contexte numérique / Dorsaf Ben Ismail Ben Romdhane ; sous la direction de Denis Legros / Saint-Denis : Université de Paris VIII , 2011
Математические методы в психиатрии и неврологии (12-15 ноября 1968 г.) : материалы симпозиума / [редактор : И.М. Тонконогий] / Ленинград : [Академия наук СССР] , 1968
Towards a global and systemic understanding of protein production in prokaryotes / par Emanuele Leoncini ; sous la direction de Philippe Robert / [S.l.] : [s.n.] , 2013
Systems Pharmacology and Pharmacodynamics / edited by Donald E. Mager, Holly H.C. Kimko. / 1st ed. 2016. / Cham : Springer International Publishing , 2016
Reconstruction de réseaux à partir de données génomiques et cliniques / Nadir Sella ; sous la direction de Hervé Isambert / , 2019
Intégration de données et caractérisation du microenvironnement tumoral de tumeurs rares / Melissa Alamé ; sous la direction de Emmanuel Cornillot / , 2020
Erythroid differentiation in vitro under the lens of mathematical modelling / Ronan Duchesne ; sous la direction de Olivier Gandrillon et de Fabien Crauste / , 2019
Outils et concepts de biologie systémique pour la modélisation prédictive de la toxicité / Jérémy Hamon ; sous la direction de Frédéric Bois / , 2013
Dynamique d'un réseau métabolique avec un modèle à base de contraintes : approche par échantillonnage des trajectoires solutions / Thomas Duigou ; sous la direction de Armel Guyonvarch / , 2015
Régulation réciproque entre les microARN et leurs cibles / Sophie Mockly ; sous la direction de Hervé Seitz / , 2021
Étude de la variabilité inter-individuelle du transcriptome soumis à un stimulus / Nicolas Derian ; sous la direction de Adrien Six et de Éric Vicaut / , 2016
Multi-omics integration and systems immunology application in rheumatology / Marie Binvignat ; sous la direction de Jérémie Sellam et de Maria de la Encarnacion Mariotti-Ferrandiz / , 2024
Reasoning on the response of logical signaling networks with answer set programming / Santiago Videla ; sous la direction de Anne Siegel et de Torsten Schaub / [Lieu de publication inconnu] : [éditeur inconnu] , 2014
Evolving information in living systems : a pathway for the understanding of cooperation and other major transitions / Livio Riboli-Sasco ; sous la direction de François Taddéi / [S.l.] : [s.n.] , 2010
Synthesis of Boolean Networks from the Structure and Dynamics of Reaction Networks / Athénaïs Vaginay ; sous la direction de Taha Boukhobza et de Malika Smaïl-Tabbone / , 2023
Encyclopedia of bioinformatics and computational biology / editors-in-chief : Shoba Ranganathan, Michael Gribskov, Kenta Nakai...[et al.] / Amsterdam : Elsevier
Apprentissage statistique pour les ensembles de réseaux booléens et les données scRNA-seq / Gustavo Magaña Lopez ; sous la direction de Loïc Pauleve / , 2025
Biomolecular feedback systems / Domitilla Del Vecchio, Richard M. Murray / Princeton (N. J.) : Princeton University Press , cop. 2015
Nouvelles approches informatiques et mathématiques pour la résolution de problèmes biologiques / Mohamed Lemine Ahmed Sidi ; sous la direction de Emmanuel Néron et de Mohamedade Farouk Nanne et de Ronan Bocquillon / , 2022
Modular Response Analysis Theory and Applications / Meriem Mekedem ; sous la direction de Jacques Colinge / , 2022
Modélisation cinétique du métabolisme : construction du modèle, analyse et applications biotechnologiques = = Kinetic models of metabolism : model construction, model analysis and biotechnological applications / Adrien Henry ; sous la direction de Olivier Martin / [Lieu de publication inconnu] : [éditeur inconnu] , 2015
Identification de réseaux de régulation génique à partir de données d'expression : une approche basée sur les modèles affines par morceaux / Samuel Drulhe ; sous la direction de Hidde de Jong / , 2008
The physics of living systems / by Fabrizio Cleri / [Cham] : Springer
Des données biologiques à la modélisation moléculaire : application au signal TGF-β et à la fibrose hépatique / Jérémy Gruel ; [sous la direction de] Nathalie Théret / Lille : Atelier national de reproduction des thèses , 2009
Molecular control of the Endothelial to Hematopoietic Transition / Hanane Khoury ; sous la direction de Thierry Jaffredo / , 2019
Combining knowledge-based and sequence comparison approaches to elucidate metabolic functions, from pathways to communities / Arnaud Belcour ; sous la direction de Anne Siegel / , 2022
Changements cellulaires et moléculaires précoces au site d'injection des vaccins : Caractérisation de la réponse innée et adaptative à l'injection d'un MVA recombinant / Pierre Rosenbaum ; sous la direction de Roger Le Grand / , 2016
Subgraph Epimorphisms : Theory and Application to Model Reductions in Systems Biology / Steven Gay / Villeurbanne : [CCSD] , 2015
De la biologie à la médecine personnalisée : mieux soigner demain ? / Béatrice Desvergne / Paris : Editions rue d'Ulm , DL 2019
Reconstruction de réseaux fonctionnels et analyse causale en biologie des systèmes / Séverine Affeldt ; sous la direction de Hervé Isambert / , 2015
Applications de l'apprentissage statistique à la biologie computationnelle / Edouard Pauwels ; sous la direction de Véronique Stoven / , 2013
Harnessing multi-omics data to unravel the genetic and molecular basis of complex traits : A systems genetics study of maize drought response / Yacine Djabali ; sous la direction de Mélisande Blein-Nicolas et de Marie-Laure Martin / , 2023
All about bioinformatics : from beginner to expert / Yasha Hasija / London : Academic Press, an imprint of Elsevier
Omics technologies and bio-engineering 1, Emerging fields, animal and medical biotechnologies : towards improving quality of life / edited by Debmalay Barh, Vasco Azevedo / London : Academic Press
Exploitation des outils statistiques pour l'intégration des données omiques en biologie végétale et animale / Emile Mardoc ; sous la direction de Jérôme Salse / , 2023
A complex systems approach to epilepsy : concept, practice, and therapy / Rod C. Scott, J. Matthew Mahoney / Cambridge : Cambridge University Press
Physiological constraints and evolutionary trade-offs underlying bacterial aging, caloric restriction and longevity / Yifan Yang ; sous la direction de François Taddei et de Ariel Lindner / , 2015
Modélisation de phénomènes biologiques complexes : application à l'étude de la réponse antigénique de lymphocytes B sains et tumoraux / Nicolas Jung ; sous la direction de Seiamak Bahram / , 2016
Clinical bioinformatics / edited by Ronald Trent,... / 2nd edition / New York : Humana Press , cop. 2014
Reconstruction de réseaux de gènes à partir de données d'expression par déconvolution centrée autour des hubs / Adel Ait-Hamlat ; sous la direction de Alessandra Carbone et de Thierry Jaffredo / , 2019
Analyse des voies métaboliques au cours du cycle cellulaire : application au métabolisme du cancer / Cécile Moulin ; sous la direction de Sabine Pérès / , 2020
Systems biology / edited by Robert A. Meyers / Weinheim : Wiley-Blackwell , cop. 2012
Modélisation, analyse et contrôle pour la biologie des systèmes : application à des modèles de croissance de bactéries / Alfonso Carta ; sous la direction de Jean-Luc Gouzé et de Madalena Chaves / , 2014
Modélisation biogéochimique du système ”Irrigation-sol-plante-nappe” : Application à la durabilité du système de culture du foin de Crau / Gihan Mohammed ; sous la direction de Fabienne Trolard et de Marina Gillon / , 2017
Contribution à l'étude de l'héritabilité d'une fonction de plusieurs caractères / Christiane Mourgues ; sous la direction de M. Braconnier / Lyon : Travaux du Laboratoire de Zoologie Expérimentale de la Faculté de sciences de Lyon , 1965
Modélisation algébrique de la dynamique multi-échelles des réseaux de régulation biologique : méthodes de modélisation et d'analyse pour l'enrichissement des Frappes de Processus / Maxime Folschette ; sous la direction de Olivier Roux / , 2014
Omics applications for systems biology / Wan Mohd Aizat, Hoe-Han Goh, Syarul Nataqain Baharum, editors / Cham : Springer
Réseaux de réactions : de l'analyse probabiliste à la réfutation / Vincent Picard ; sous la direction de Anne Siegel et de Jérémie Bourdon / , 2015
Model Building by Temporal Logic Constraint Solving : Investigation of the Coupling between the Cell Cycle and the Circadian Clock / Pauline Traynard ; sous la direction de François Fages et Denis Thieffry / [Lieu de publication inconnu] : [éditeur inconnu] , 2016
Integrative analysis and modeling of molecular pathways dysregulated in rheumatoid arthritis / Vidisha Singh ; sous la direction de Elisabeth Petit-Teixeira et de Anna Niarakis / , 2020
Computational methods in synthetic biology / edited by Mario Andrea Marchisio,... / Second edition / New york : Springer
Mechanistic insights into vaccine-induced innate immune responses from integrating prior knowledge and experimental data with Boolean models / Vincent Deman ; sous la direction de Anne-Sophie Beignon et de Philippe Castera et de Marine Ciantar / , 2025
Biomedical literature mining / edited by Vinod D. Kumar, Hannah Jane Tipney / New York, NY : Humana Press , cop. 2014
Systems biology / edited by Ivan V. Maly,... / New York (N.Y.) : Humana Press
Microbial systems biology : methods and protocols / edited by Ali Navid,... / New York [etc.] : Humana Press , cop. 2012
Apport de la modélisation numérique à l'innovation et au développement de nouvelles thérapeutiques : approche théorique, modèle simplifié et application à l'athérosclérose / Riad Kahoul ; sous la direction de Jean-Pierre Boissel et de François Gueyffier / , 2012
Comprendre l'adaptation de Lactococcus lactis par une approche de biologie intégrative à l'échelle du génome / Clémentine Dressaire ; [sous la direction de] Muriel Cocaign- Bousquet / Lille : Atelier national de reproduction des thèses , 2009
Emergence de structures modulaires dans les régulations des systèmes biologiques : théorie et applications à Bacillus subtilis / Anne Goelzer ; sous la direction de Gérard Scorletti et de Vincent Fromion / [S. l]. : [S. n.] , 2010
Fundamentals of systems biology : from synthetic circuits to whole-cell models / Markus W. Covert,... / Boca Raton : CRC Press,Taylor & Francis Group , cop. 2015
Logic programming tools for metabolic fluxes analysis and biological applications / Maxime Mahout ; sous la direction de Sabine Pérès / , 2023
Systems Biomedicine : Concepts and Perspectives / Edison T. Liu ; Douglas A. Lauffenburger / San Diego, CA : Elsevier Science , 2009
Software tools and algorithms for biological systems / Hamid R. Arabnia, Quoc-Nam Tran, editors / New York, NY : Springer New York
Advances in Bio-Imaging : From Physics to Signal Understanding Issues : State-of-the-Art and Challenges / Nicolas Loménie, Daniel Racoceanu, and Alexandre Gouaillard (Eds.) / Heidelberg : Springer , cop. 2012
De la biologie à la médecine personnalisée : mieux soigner demain ? / Béatrice Desvergne / Paris : Editions rue d'Ulm , 2019
Methods and tools for the optimal design of experiments applied to the efficient characterization of enzyme-mediated escape to antimicrobial treatments / Arthur Carcano ; sous la direction de Grégory Batt / , 2021
Systems Biology / edited by Michael G. Katze / 1st ed. 2013. / Berlin, Heidelberg : Springer Berlin Heidelberg , 2013
Omics approaches, technologies and applications : integrative approaches for understanding OMICS Data / Preeti Arivaradarajan, Gauri Misra, editors / 1st ed. 2018. / Singapore : Springer Nature Singapore , 2018
Correlation between lipopeptide biosynthesis and their precursor metabolism in Bacillus subtilis / Debarun Dhali ; sous la direction de Philippe Jacques et de François Coutte / , 2016
Applied Computational Genomics / edited by Yin Yao Shugart. / 1st ed. 2012. / Dordrecht : Springer Netherlands , 2012
German Medical Data Sciences 2021 : digital medicine: Recognize -- Understand -- Heal : proceedings of the Joint Conference of the 66th Annual Meeting of the German Association of Medical Informatics, Biometry, and Epidemiology e.V. (gmds) and the 13th Annual Meeting of the TMF -- Technology, Methods, and Infrastructure for Networked Medical for Networked Medical Research e.V. 2021 online in Kiel, Germany / edited by Rainer Röhrig,... Tim Beiβbarth,... Jochem König,... [et al.] / Amsterdam, [etc.] : IOS Press
A first course in systems biology / Eberhard O. Voit / Second edition / New York : Garland Science
Pipeline for the systematic characterization of heterologous protein secretory load to assess bioproduction efficiency / Sebastián Sosa-Carrillo ; sous la direction de Grégory Batt / , 2021
Modeling in systems biology : the Petri net approach / Ina Koch, Wolfgang Reisig, Falk Schreiber, editors / London : Springer , cop. 2011
Modélisation : outil de compétitivité : Montbonnot INRIA Grenoble Rhônes-Alpes, 8 & 9 juillet 2008 / forum organisé par GRAVIT / Grenoble (Isère) : GRAVIT , 2008
Mathematical concepts and methods in modern biology : using modern discrete models / edited by Raina Robeva,... Terrell L. Hodge,... / Amsterdam : Academic Press , cop. 2013
Investigating host-microbiota cooperation with gap-filling optimization problems / Clémence Frioux ; sous la direction de Anne Siegel / , 2018
Predicting transcription factor complexes : a novel approach to data integration in systems biology / by Thorsten Will / Wiesbaden : Springer Spektrum , cop. 2015
Computer-aided design (CAD) tools for bioproduction and biosensing pathway engineering / Baudoin Delépine ; sous la direction de Jean-Loup Faulon et de Pablo Carbonell / , 2017
Découverte et exploration des modules conservés de transformations chimiques dans le métabolisme / Maria Sorokina ; sous la direction de Claudine Médigue et de David Vallenet / [Lieu de publication inconnu] : [éditeur inconnu] , 2016
Une approche de modélisation de biologie des systèmes sur la spondylarthrite / Emmanuel Chaplais ; sous la direction de Henri-Jean Garchon / , 2015
Analyse quantitative des régulations de la traduction chez Lactococcus lactis par une approche de biologie des systèmes / Flora Picard ; sous la direction de Muriel Cocaign-Bousquet et de Laurence Girbal / , 2012
Artificial immune systems and their applications / Dipankar Dasgupta (ed.) / Berlin : Springer
Methods in systems biology / edited by Daniel Jameson, Malkhey Verma, and Hans V. Westerhoff / Amsterdam : AcademicPress , 2011
Systems biology : definitions and perspectives / Lilia Alberghina, Hans V. Westerhoff, (eds.) / Berlin : Springer , cop. 2008
Identification de signature causale pathologie par intégration de données multi-omiques / Méline Wery ; sous la direction de Olivier Dameron et de Anne Siegel / , 2020
Modélisation computationnelle de l'absorption intestinale du glucose pour la prédiction du diabète de Type 2 / Danilo Dursoniah ; sous la direction de Cédric Lhoussaine et de François Pattou et de Maxime Folschette / , 2024
Towards a global and systemic understanding of protein production in prokaryotes / par Emanuele Leoncini ; sous la direction de Philippe Robert / Lille : Atelier national de reproduction des thèses , 2013
Systems biology : a textbook / Edda Klipp, Wolfram Liebermeister, Christoph Wierling... [et al.] / Weinheim : Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA
Étude du rôle des NTIC sur la construction de connaissances scientifiques dans le domaine de la biologie : implication pour la didactique de la biologie en contexte numérique / Dorsaf Ben Ismail Ben Romdhane ; sous la direction de Denis Legros / Lille : Atelier national de reproduction des thèses , 2011
Towards an integrative approach for the modeling and formal verification of biological regulatory networks / Pedro Tiago Gonçalves Monteiro ; sous la direction de Ana Teresa Correia de Freitas et de Hidde de Jong et de Radu Mateescu / , 2010
In silico systems biology / edited by Maria Victoria Schneider / New York : Humana Press , cop. 2013
Elaboration d'hydrogels de chitine induite par non-solvant : relations procédé-produit / Yasinee Chakrabandhu ; sous la direction de Jean-Pierre Desfours / Montpellier : Université de Montpellier 2 Sciences et Techniques du Languedoc , 2009
Caractérisation du métabolisme de Eubacterium limosum par une approche quantitative de biologie des systèmes / Guillaume Pregnon ; sous la direction de Philippe Soucaille / Toulouse : INSA Toulouse , 2022
Elaboration d'hydrogels de chitine induite par non-solvant : relations procédé-produit / Yasinee Chakrabandhu ; sous la direction de Jean-Pierre Desfours / Lille : Atelier national de reproduction des thèses , 2009
Integration of omics approaches and systems biology for clinical applications / edited by Antonia Vlahou, Harald Mischak, Jerome Zoidakis... [et al.] / Hoboken, NJ : Wiley , 2018
Identification of new therapeutic targets for cystic fibrosis using systems biology and chemogenomics approaches / Matthieu Najm ; sous la direction de Véronique Stoven et de Laurence Calzone / , 2023
Emergence de structures modulaires dans les régulations des systèmes biologiques : théorie et applications à Bacillus subtilis / Anne Goelzer ; sous la direction de Gérard Scorletti et de Vincent Fromion / , 2010
Genomics of fitness in periodic stress / Jérôme Salignon ; sous la direction de Gaël Yvert / , 2017
Causal network analysis of single cell multi-omics data applied to a cellular therapy against multiple sclerosis / Louise Dupuis ; sous la direction de Hervé Isambert et de Simon Fillatreau / , 2024
Systems Biology : International Research and Development / by Marvin Cassman,... Adam Arkin,... Frank Doyle,... [et al.] / Dordrecht : Springer Netherlands
An Introduction to high content screening : imaging technology, assay development, and data analysis in biology and drug discovery / editors : Steven A. Haney, Douglas Bowman, Arijit Chakravarty ; associate editors : Anthony Davies, Caroline Shamu / [Hoboken (N.J.)] : Wiley , 2015
Introduction to systems biology / edited by Sangdun Choi,... / Totowa (N.J.) : Humana Press , cop. 2007
Mathematical concepts and methods in modern biology : using modern discrete models / edited by Raina Robeva, Terrell L. Hodge / Amsterdam : Academic Press , [2013]
Modélisation et simulation pour la post-génomique / sous la direction de Jean-Paul Comet, Marcelline Kaufman / Paris : Hermès science publications , 2007
Vérification formelle et apprentissage logique pour la modélisation qualitative à partir de données single-cell / Samuel Buchet ; sous la direction de Morgan Magnin et de Olivier Roux / , 2022
Mathematical models in computational surgery / Stefano Casarin ; sous la direction de Marc Garbey et de Scott A. Berceli / , 2017
Analyse mathématique de la dynamique de réseaux de régulation biologique / Ousmane Diop ; sous la direction de Vincent Fromion / , 2020
Philosophie et cellules souches : Le futur antérieur au coeur de la médecine régénératrice / Benoît Elichabe ; sous la direction de Alain Leplège et Claude Debru / [Lieu de publication inconnu] : [éditeur inconnu] , 2015
Une approche bioinformatique intégrative pour la recherche de cibles physiopathologiques dans les maladies complexes : une application aux données transcriptomiques / Edi Prifti ; sous la direction de Jean-Daniel Zucker / [S.l.] : [s.n.] , 2011
Multiscale analysis and nonlinear dynamics : from genes to the brain / edited by Misha (Meyer) Z. Pesenson / Weinheim, Germany : Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA , 2013
Modélisation et simulation numérique en biologie : application aux méthodes de transport / Jean-Michel Claverie / [S.l.] : [s.n.] , 1977
Multi-scale modeling of hepatic drug toxicity and its consequences on ammonia detoxification / Géraldine Celliere ; sous la direction de Dirk Drasdo / , 2016
Cancer systems biology : methods and protocols / edited by Louise von Stechow,... / New York : Humana Press
Modeling and simulation in the medical and health sciences / edited by John A. Sokolowski, ... Catherine M. Banks, ... / Hoboken, N. J. : John Wiley , cop. 2011
Математические модели генетических систем : сборник научных трудов / Академия наук СССР, Сибирское отделение, Институт цитологии и генетики ; ред. д.б.н. В.А. Ратнер / Новосибирск : [с.н.] , 1976
Applying Systems Biology and Multi-layered Profiling Towards a Comprehensive Understanding of Cell Aging / Jose Americo Nabuco Leva Ferreira de Freitas ; sous la direction de Oliver Bischof et de Benno Schwikowski / , 2020
Modélisation et vérification des réseaux de Petri hybrides temporisés : application à la métamorphose amphibienne / Sylvie Troncale ; sous la direction de Gilles Bernot et de Jean-Paul Comet / , 2008
Modélisation du métabolisme de la microalgue oléagineuse d'intérêt industriel Microchloropsis gaditana / Clémence Dupont thibert ; sous la direction de Gilles Curien / , 2023
Apport des sciences omiques dans la maladie de Fabry / Sarah Snanoudj-Verber ; sous la direction de Soumeya Bekri et de Stéphane Marret / , 2023
Etude des effets d'une exposition aux rayonnements ionisants sur le développement du poisson zèbre par une approche de biologie des systèmes / Sophia El Houdigui Murat ; sous la direction de Christelle Adam-Guillermin et de Olivier Armant / , 2020
Studying a stochastic gene regulatory network driving the germinal center B cell differentiation / Alexey Koshkin ; sous la direction de Olivier Gandrillon et de Fabien Crauste / , 2021
Biological Petri nets / edited by Edgar Wingender, ... / Amsterdam : IOS Press
Reasoning on the response of logical signaling networks with answer set programming / Santiago Videla ; sous la direction de Anne Siegel et de Torsten Schaub / , 2014
Méthodes qualitatives pour la construction et l'analyse des réseaux moléculaires SBGN / Adrien Rougny ; sous la direction de Christine Froidevaux / , 2016
Du calcul au vivant : le défi d'une science de l'organisation / Walter Fontana,... / [Paris] : Collège de France , DL 2020
Systems chemical biology : methods and protocols / edited by Slava Ziegler,... Herbert Waldmann,... / New York : Humana Press
Modélisation de la bascule métabolique chez les cellules eucaryotes : application à la production de citrate chez la levure Yarrowia lipolytica / Jorgelindo Da veiga moreira ; sous la direction de Laurent Schwartz et de Sabine Pérès / , 2019
Systems biology in drug discovery and development : methods and protocols / edited by Qing Yan / New York [N.Y.] : Humana Press , cop. 2010
Hyperbolic and kinetic models for self-organised biological aggregations : a modelling and pattern formation approach / Raluca Eftimie / Cham : Springer International Publishing
Modeling methods for medical systems biology : regulatory dynamics underlying the emergence of disease processes / María Elena Álvarez-Buylla Roces, Juan Carlos Martínez-García, José Dávila-Velderrain, [et al.] / Cham : Springer
Data mining for systems biology : methods and protocols / edited by Hiroshi Mamitsuka, Charles DeLisi, Minoru Kanehisa / New York : Humana Press , 2013
Systems biology : constraint-based reconstruction ans analysis / Bernhard O. Palsson,... / Cambridge : Cambridge University Press , cop. 2015
Etude de la toxicité rénale de la cyclosporine A à l'aide d'un modèle de biologie systémique de la voie de signalisation Nrf2 / par Jérémy Hamon ; [sous la direction de] Benoît Hosten / [Lieu de publication inconnu] : [éditeur inconnu] , 2014
Systems biology / Guest editors, Walter Kolch, Dirk Fey, Colm J. Ryan / London : Portland Press
Développement de méthodes évolutionnaires d'extraction de connaissance et application à des systèmes biologiques complexes / Benjamin Linard ; sous la direction de Julie Thompson / , 2012
Approches bioinformatiques pour l'exploration sans a priori des voies moléculaires chez les espèces non modèles : le cas du métabolisme lipidique chez Gammarus fossarum / Natacha Koenig ; sous la direction de Olivier Geffard et de Davide Degli Esposti / , 2022
Understanding responses to external stimuli using network-based approaches / Konrad Frederik Gwinner ; sous la direction de Heribert Hirt et de Benno Schwikowski / [S.l.] : [s.n.] , 2014
An Introduction to systems biology : design principles of biological circuits / Uri Alon / 2nd edition / Boca Raton (Fl.) : CRC Press
German medical data sciences : bringing data to life : proceedings of the Joint Annual Meeting of the German Association of Medical Informatics, Biometry and Epidemiology (gmds e.V.) and the Central European Network - International Biometric Society (CEN-IBS) 2020 in Berlin, Germany / edited by Rainer Röhrig,... Tim Beißbarth,.. Werner Braannath,... [et al.] / Amsterdam [etc.] : IOS Press
Comparaison de différentes voies d'administration vaccinale et leur immunogénicité par une approche de biologie des systèmes / Eléna Gonçalves ; sous la direction de Béhazine Combadière / , 2020
Towards a global and systemic understanding of protein production in prokaryotes / par Emanuele Leoncini ; sous la direction de Philippe Robert / Villeurbanne : TEL , 2014
Examination Questions and Answers in Basic Anatomy and Physiology : 2900 Multiple Choice Questions and 64 Essay Topics / by Martin Caon / Cham : Springer International Publishing
Sciences des systèmes et repositionnement de molécules thérapeutiques : une approche d'avenir permettant d'atteindre une innovation thérapeutique efficiente ? / par Mohamed Abou Ali ; [sous la direction du] Pr Florence Allouche / , 2021
Modélisation de la susceptibilité génétique non observée d'un individu à partir de son histoire familiale de cancer : application aux études d'identification pangénomiques et à l'estimation du risque de cancer dans le syndrome de Lynch / Youenn Drouet ; sous la direction de Christine Lasset et de Pascal Roy / , 2012
Subgraph Epimorphisms : Theory and Application to Model Reductions in Systems Biology / Steven Gay ; sous la direction de François Fages / , 2015
Probabilistic and constraint based modelling to determine regulation events from heterogeneous biological data / Andrés Octavio Aravena Duarte ; sous la direction de Anne Siegel et de Alejandro Maass / , 2013
Bioinformatic and modelling approaches for a system-level understanding of oxidative stress toxicity / Elias Zgheib ; sous la direction de Frédéric Bois / , 2018
Modèles réduits et hybrides de réseaux de réactions biochimiques : applications à la modélisation du cycle cellulaire / Vincent Noël ; [sous la direction de] Ovidiu Radulescu, Nathalie Théret / Lille : Atelier national de reproduction des thèses , 2012
Identification de réseaux de régulation génique à partir de données d'expression : une approche basée sur les modèles affines par morceaux. / Samuel Drulhe ; sous la direction de Hidde de Jong / Lille : Atelier national de reproduction des thèses , 2007
Network biology : methods and applications / edited by Gerard Cagney,... Andrew Emili,... / New York (N.Y.) : Humana press , cop. 2011
Méthodes de classification de réseaux d'intéractions protéine-protéine et évaluations pour l'étude de la fonction / Benoit Robisson ; sous la direction de Christine Brun / , 2013
Statistical and evolutionary analysis of biological networks / editors Michael P. H. Stumpf, Carsten Wiuf / Imperial college press : London , 2010
The genotype-phenotype relationship across different scales / Henry Kemble ; sous la direction de Olivier Tenaillon et de Philippe Nghe / , 2018
Analyse quantitative des régulations de la traduction chez Lactococcus lactis par une approche de biologie des systèmes / Flora Picard ; sous la direction de Muriel Cocaign-bousquet et de Laurence Girbal / Toulouse : INSA , 2012
Modélisation gros grains et simulation multi-agents : application à la membrane interne mitochondriale / [présentée] par Charles Lales ; [sous la direction de] R. Strandh, M. Beurton-Aimar et J.-P. Mazat / Lille : Atelier national de reproduction des thèses , 2007
Étude des réseaux biologiques à grande échelle par modélisation statique et résolution des contraintes / Carito Guziolowski ; [sous la direction de] Anne Siegel / Lille : Atelier national de reproduction des thèses , 2010
Design and analysis of biomolecular circuits : engineering approaches to systems and synthetic biology / Heinz Koeppl ... [et al], editors / New York : Springer Science+Business Media , cop. 2011
Unfoldings and Abstract Interpretation for Parametric Biological Regulatory Networks / Juraj Kolcak ; sous la direction de Stefan Haar / , 2021
Systems biology of Alzheimer's disease / Edited by Juan I. Castrillo, Stephen G. Oliver / New York : Humana Press , cop. 2016
Encyclopedia of systems biology / Werner Dubitzky, Olaf Wolkenhauer, Kwang-Hyun Cho... [et al.], editors / New York (N.Y) : Springer , cop. 2013
The challenges of systems biology : community efforts to harness biological complexity / edited by Gustavo Stolovitzky, Pascal Kahlem, and Andrea Califano / Boston, Mass. : Published by Blackwell Pub. on behalf of the New York Academy of Sciences , 2009
Analyse des réseaux moléculaires impliqués dans le remodelage ventriculaire gauche post-infarctus du myocarde et dans l'insuffisance cardiaque / Marie Cuvelliez ; sous la direction de Christophe Bauters / , 2019
Modélisation gros grains et simulation multi-agents : application à la membrane interne mitochondriale / [présentée] par Charles Lales ; [sous la direction de] R. Strandh, M. Beurton-Aimar et J.-P. Mazat / , 2007
Complétion combinatoire pour la reconstruction de réseaux métaboliques, et application au modèle des algues brunes Ectocarpus siliculosus / Sylvain Prigent ; sous la direction de Anne Siegel et de Thierry Tonon / , 2014
Causes and consequences of physiological constraints on evolutionary models : new insights on the evolution of ageing and heredity / Grégory Paul ; sous la direction de François Taddeï / Lille : Atelier national de reproduction des thèses , 2007
Des données biologiques à la modélisation moléculaire : application au signal TGF-β et à la fibrose hépatique / Jérémy Gruel ; [sous la dir. de] Nathalie Théret / [S.l.] : [s.n.] , 2009
Méthodes de classification de réseaux d'intéractions protéine-protéine et évaluations pour l'étude de la fonction / Benoit Robisson ; sous la direction de Christine Brun / [S.l.] : [s.n.] , 2013
Explorations Multi-omiques dans les maladies neuromusculaires / Ivana Dabaj ; sous la direction de Soumeya Bekri et de Stéphane Marret / , 2023
Modélisation et vérification des réseaux de Petri hybrides temporisés : application à la métamorphose amphibienne / Sylvie Troncale ; sous la direction de Gilles Bernot et de Jean-paul Comet / S. l. : Evry-Val d'Essonne , 2008
Biological networks and pathway analysis : Methods and Protocols / edited by Tatiana V. Tatarinova,... Yuri Nikolsky,... / New York : Humana Press
Multi-omics data integration and interactive visual data mining to explore mitochondrial dynamics / Fabio Marchiano ; sous la direction de Bianca Habermann et de Sébastien Tempel / , 2022
Analyse systémique du métabolisme carboné et énergétique de Chlamydomonas reinhardtii / Arnaud Martzolff ; sous la direction de Jack Legrand ; co-encadrant Guillaume Cogne / [Lieu de publication inconnu] : [Éditeur inconnu] , 2013
Step-wise target controllability of driver nodes in biological networks / Giulia Bassignana ; sous la direction de Fabrizio De Vico Fallani / , 2020
Multiciblage de la famille HER (ErbB) dans le cancer du pancréas : validation d'une thérapie innovante à base d'anticorps bispécifiques tétravalents et leur comparaison in vitro et in vivo aux combinaisons d'anticorps parentaux monospécifiques / Emilia Rabia ; sous la direction de Thierry Chardès / , 2021
Rôle du régulateur post-transcriptionnel CSR dans l'adaptation métabolique de la bactérie modèle Escherichia coli / Manon Morin ; sous la direction de Muriel Cocaign-Bousquet et de Delphine Ropers / , 2015
Application de la biologie des systèmes pour l'identification de marqueurs moléculaires des maladies rénales dans les fluides biologiques / Franck Boizard ; sous la direction de Joost-Peter Schanstra et de Olivier Teste / , 2019
Réseaux de réactions : de l’analyse probabiliste à la réfutation / Vincent Picard le 2015 [ Rennes 1 ]
Prédiction de la structure de contrôle de bactéries par optimisation sous incertitude / Marouane Ait El Faqir le 2016 [ Lyon ]
Erythroid differentiation in vitro under the lens of mathematical modelling / Ronan Duchesne le 2019 [ Lyon ]
MIM-Logic : a logic for reasoning about molecular interaction maps / Naji Obeid le 2014 [ Toulouse 3 ]
Understanding responses to external stimuli using network-based approaches / Konrad Frederik Gwinner le 2014 [ Evry-Val d'Essonne ]
Reasoning on the response of logical signaling networks with answer set programming / Santiago Videla le 2014 [ Rennes 1 ]
Towards a global and systemic understanding of protein production in prokaryotes / Emanuele Leoncini le 2013 [ Palaiseau, Ecole polytechnique ]
Identification de signature causale pathologie par intégration de données multi-omiques / Méline Wery le 2020 [ Rennes 1 ]
Caractérisation du métabolisme de Eubacterium limosum par une approche quantitative de biologie des systèmes / Guillaume Pregnon le 2022 [ Toulouse, INSA ]
Exploitation des outils statistiques pour l'intégration des données omiques en biologie végétale et animale / Emile Mardoc le 2023 [ Université Clermont Auvergne (2021-...) ]
Logic programs to infer computational models of human embryonic development / Mathieu Bolteau le 2024 [ Nantes Université ]
Identification de réseaux de régulation génique à partir de données d'expression : une approche basée sur les modèles affines par morceaux / Samuel Drulhe le 2008 [ Université Joseph Fourier (Grenoble, Isère, France ; 1971-2015) ]
Studying a stochastic gene regulatory network driving the germinal center B cell differentiation / Alexey Koshkin le 2021 [ Lyon ]
Reconstruction de réseaux fonctionnels et analyse causale en biologie des systèmes / Séverine Affeldt le 2015 [ Paris 6 ]
Transmission d'informations par perturbations dynamiques dans les réseaux métaboliques / Arthur Lequertier le 2025 [ université Paris-Saclay ]
Modélisation incrémentale des réseaux biologiques / Anastasia Yartseva Smidtas le 2007 [ Evry-Val d'Essonne ]
Analyses et prédictions bioinformatiques de réseaux d'interactions protéine-protéines contextualisés / Oussema Souiai le 2011 [ Aix-Marseille 2 ]
Elaboration d'hydrogels de chitine induite par non-solvant : relations procédé-produit / Yasinee Chakrabandhu le 2009 [ Montpellier 2 ]
Étude de la variabilité inter-individuelle du transcriptome soumis à un stimulus / Nicolas Derian le 2016 [ Paris 6 ]
Caractérisation de la diversité du répertoire TCR par modélisation de données de séquençage haut-débit / Wahiba Chaara le 2016 [ Paris 6 ]
Méthodes de classification de réseaux d'intéractions protéine-protéine et évaluations pour l'étude de la fonction / Benoit Robisson le 2013 [ Aix-Marseille ]
Probabilistic and constraint based modelling to determine regulation events from heterogeneous biological data / Andrés Octavio Aravena Duarte le 2013 [ Rennes 1 ]
Étude exhaustive de voies de signalisation de grande taille par clustering des trajectoires et caractérisation par analyse sémantique / Jean Coquet le 2017 [ Rennes 1 ]
Physiological constraints and evolutionary trade-offs underlying bacterial aging, caloric restriction and longevity / Yifan Yang le 2015 [ Sorbonne Paris Cité ]
Towards an integrative approach for the modeling and formal verification of biological regulatory networks / Pedro Tiago Gonçalves Monteiro le 2010 [ Lyon 1 ]
Analyse quantitative des régulations de la traduction chez Lactococcus lactis par une approche de biologie des systèmes / Flora Picard le 2012 [ Toulouse, INSA ]
Applications de l'apprentissage statistique à la biologie computationnelle / Edouard Pauwels le 2013 [ Paris, ENMP ]
Intégration de données et caractérisation du microenvironnement tumoral de tumeurs rares / Melissa Alamé le 2020 [ Montpellier ]
Modélisation du métabolisme de la microalgue oléagineuse d'intérêt industriel Microchloropsis gaditana / Clémence Dupont thibert le 2023 [ Université Grenoble Alpes ]
Caractérisation de la biologie des systèmes au sein de mécanismes de régulation complexes dans des cellules cancéreuses : quantification des interactions moléculaires pour la conception et optimisation de thérapies / Gabriel Jimenez Dominguez le 2021 [ Montpellier ]
Changements cellulaires et moléculaires précoces au site d’injection des vaccins : Caractérisation de la réponse innée et adaptative à l’injection d’un MVA recombinant / Pierre Rosenbaum le 2016 [ Université Paris-Saclay (ComUE) ]
Méthodes qualitatives pour la construction et l'analyse des réseaux moléculaires SBGN / Adrien Rougny le 2016 [ Université Paris-Saclay (ComUE) ]
Etude des effets d'une exposition aux rayonnements ionisants sur le développement du poisson zèbre par une approche de biologie des systèmes / Sophia El Houdigui Murat le 2020 [ Aix-Marseille ]
Pipeline for the systematic characterization of heterologous protein secretory load to assess bioproduction efficiency / Sebastián Sosa-Carrillo le 2021 [ Université Paris Cité ]
Unfoldings and Abstract Interpretation for Parametric Biological Regulatory Networks / Juraj Kolcak le 2021 [ université Paris-Saclay ]
Simplifications exactes et structurelles de réseaux de réactions biologiques / Guillaume Madelaine le 2017 [ Lille 1 ]
Modélisation et vérification des réseaux de Petri hybrides temporisés : application à la métamorphose amphibienne / Sylvie Troncale le 2008 [ Evry-Val d'Essonne ]
Analyse de réseaux de régulation par approches de coloration de graphes dans le cadre du myélome multiple / Bertrand Miannay le 2017 [ Ecole centrale de Nantes ]
Methods and tools for the optimal design of experiments applied to the efficient characterization of enzyme-mediated escape to antimicrobial treatments / Arthur Carcano le 2021 [ Université Paris Cité ]
Discrete event modeling and analysis for systems biology models / Hayssam Soueidan le 2009 [ Bordeaux 1 ]
Modélisation algébrique de la dynamique multi-échelles des réseaux de régulation biologique : méthodes de modélisation et d'analyse pour l'enrichissement des Frappes de Processus / Maxime Folschette le 2014 [ Ecole Centrale de Nantes ]
Développement de méthodologies de reconstruction et d’analyse des réseaux de signalisation de protéines impliquées dans le cancer à partir de données phosphoprotéomiques par approches de la biologie systémique / Marion Buffard le 2021 [ Montpellier ]
Régulation réciproque entre les microARN et leurs cibles / Sophie Mockly le 2021 [ Montpellier ]
Algorithmes pour la prédiction de stratégies de reprogrammation cellulaire dans les réseaux Booléens. / Hugues Mandon le 2019 [ Université Paris-Saclay (ComUE) ]
Mathematical models in computational surgery / Stefano Casarin le 2017 [ La Rochelle ]
Computer-aided design (CAD) tools for bioproduction and biosensing pathway engineering / Baudoin Delépine le 2017 [ Université Paris-Saclay (ComUE) ]
Découverte et exploration des modules conservés de transformations chimiques dans le métabolisme / Maria Sorokina le 2016 [ Université Paris-Saclay (ComUE) ]
Modular Response Analysis Theory and Applications / Meriem Mekedem le 2022 [ Université de Montpellier (2022-....) ]
Une approche bioinformatique intégrative pour la recherche de cibles physiopathologiques dans les maladies complexes : une application aux données transcriptomiques / Edi Prifti le 2011 [ Paris 6 ]
Causes and consequences of physiological constraints on evolutionary models : new insights on the evolution of ageing and heredity / Grégory Paul le 2007 [ Paris 6 ]
Investigating host-microbiota cooperation with gap-filling optimization problems / Clémence Frioux le 2018 [ Rennes 1 ]
Apprentissage de données génomiques multiples pour le diagnostic et le pronostic du cancer / Matahi Moarii le 2015 [ Paris, ENMP ]
Apport de la modélisation numérique à l’innovation et au développement de nouvelles thérapeutiques : approche théorique, modèle simplifié et application à l’athérosclérose / Riad Kahoul le 2012 [ Lyon 1 ]
Analyse systémique du métabolisme carboné et énergétique de Chlamydomonas reinhardtii / Arnaud Martzolff le 2013 [ Nantes ]
Analyse multi-niveaux en biologie systémique computationnelle : le cas des cellules HeLa sous traitement apoptotique / Matthieu Pichené le 2018 [ Rennes 1 ]
Molecular control of the Endothelial to Hematopoietic Transition / Hanane Khoury le 2019 [ Sorbonne université ]
Harnessing multi-omics data to unravel the genetic and molecular basis of complex traits : A systems genetics study of maize drought response / Yacine Djabali le 2023 [ université Paris-Saclay ]
Modélisation, analyse et contrôle pour la biologie des systèmes : application à des modèles de croissance de bactéries / Alfonso Carta le 2014 [ Nice ]
Analyse mathématique de la dynamique de réseaux de régulation biologique / Ousmane Diop le 2020 [ université Paris-Saclay ]
Deep characterization of the Modified Vaccinia Ankara vaccine induced B cell response in the context of prime-boost immunization / Andre Rodriguez Pozo le 2019 [ Université Paris-Saclay (ComUE) ]
Méthodes pour l’identification des modèles de réseaux biochimiques / Sara Berthoumieux le 2012 [ Lyon 1 ]
Approches bioinformatiques pour l’exploration sans a priori des voies moléculaires chez les espèces non modèles : le cas du métabolisme lipidique chez Gammarus fossarum / Natacha Koenig le 2022 [ Lyon 1 ]
Modélisation mathématique de la dégradation des ARNm bactériens et intégration de données omiques / Thibault Étienne le 2020 [ Lyon ]
Genomics of fitness in periodic stress / Jérôme Salignon le 2017 [ Lyon ]
Modélisation probabiliste en biologie cellulaire et moléculaire / Romain Yvinec le 2012 [ Lyon 1 ]
Apprentissage statistique pour les ensembles de réseaux booléens et les données scRNA-seq / Gustavo Magaña Lopez le 2025 [ Bordeaux ]
Unsupervised hierarchical deconvolution of gene expression data to unravel the tumor micro-environment complexity / Nicolas Sompairac le 2021 [ Université Paris Cité ]
Application de la biologie des systèmes pour l'identification de marqueurs moléculaires des maladies rénales dans les fluides biologiques / Franck Boizard le 2019 [ Toulouse 3 ]
Emergence de structures modulaires dans les régulations des systèmes biologiques : théorie et applications à Bacillus subtilis / Anne Goelzer le 2010 [ Ecully, Ecole centrale de Lyon ]
Enjeux philosophiques de la biologie des systèmes / Pierre-Alain Braillard le 2008 [ Paris 1 ]
Des données biologiques à la modélisation moléculaire : application au signal TGF-β et à la fibrose hépatique / Jérémy Gruel le 2009 [ Rennes 1 ]
Comprendre l’adaptation de Lactococcus lactis par une approche de biologie intégrative à l’échelle du génome / Clémentine Dressaire le 2009 [ Toulouse, INSA ]
Modélisation gros grains et simulation multi-agents : application à la membrane interne mitochondriale / Charles Lales le 2007 [ Bordeaux 1 ]
Rôle du régulateur post-transcriptionnel CSR dans l'adaptation métabolique de la bactérie modèle Escherichia coli / Manon Morin le 2015 [ Toulouse, INSA ]
Philosophie et cellules souches : Le futur antérieur au coeur de la médecine régénératrice / Benoît Elichabe le 2015 [ Sorbonne Paris Cité ]
Model Building by Temporal Logic Constraint Solving : Investigation of the Coupling between the Cell Cycle and the Circadian Clock / Pauline Traynard le 2016 [ Sorbonne Paris Cité ]
Modélisation dynamique de la signalisation cellulaire : aspects différentiels et discrets : application à la signalisation du facteur de croissance TGF-β dans le cancer / Goeffroy Andrieux le 2013 [ Rennes 1 ]
Outils et concepts de biologie systémique pour la modélisation prédictive de la toxicité / Jérémy Hamon le 2013 [ Compiègne ]
Analyse de l'émergence de Salmonella Senftenberg dans les productions avicoles / Zineb Boumart le 2012 [ Tours ]
Mechanistic insights into vaccine-induced innate immune responses from integrating prior knowledge and experimental data with Boolean models / Vincent Deman le 2025 [ université Paris-Saclay ]
Multi-omics data integration and interactive visual data mining to explore mitochondrial dynamics / Fabio Marchiano le 2022 [ Aix-Marseille ]
La construction du réseau de régulation transcriptionnelle / Islam Sultan le 2019 [ Université Paris-Saclay (ComUE) ]
Combining knowledge-based and sequence comparison approaches to elucidate metabolic functions, from pathways to communities / Arnaud Belcour le 2022 [ Rennes 1 ]
Modélisation de la bascule métabolique chez les cellules eucaryotes : application à la production de citrate chez la levure Yarrowia lipolytica / Jorgelindo Da veiga moreira le 2019 [ Université Paris-Saclay (ComUE) ]
Comparative study of the proteome of S. coelicolor M145 and S. lividans TK24, two phylogenetically closely related strains with very different abilities to accumulate TAG and produce antibiotics / Aarón Millán Oropeza le 2017 [ Université Paris-Saclay (ComUE) ]
Méthodes de satisfiabilité hybrides pour l'inférence de régulations booléennes contrôlant des réseaux métaboliques / Kerian Thuillier le 2024 [ Université de Rennes (2023-....) ]
Vérification formelle et apprentissage logique pour la modélisation qualitative à partir de données single-cell / Samuel Buchet le 2022 [ Ecole centrale de Nantes ]
Multi-omics integration and systems immunology application in rheumatology / Marie Binvignat le 2024 [ Sorbonne université ]
Allocation optimale de ressources dans la croissance bactérienne : étude théorique et applications à la production de métabolites / Agustín Gabriel Yabo le 2021 [ Université Côte d'Azur ]
Modélisation de la susceptibilité génétique non observée d’un individu à partir de son histoire familiale de cancer : application aux études d'identification pangénomiques et à l'estimation du risque de cancer dans le syndrome de Lynch / Youenn Drouet le 2012 [ Lyon 1 ]
Multiciblage de la famille HER (ErbB) dans le cancer du pancréas : validation d’une thérapie innovante à base d’anticorps bispécifiques tétravalents et leur comparaison in vitro et in vivo aux combinaisons d’anticorps parentaux monospécifiques / Emilia Rabia le 2021 [ Montpellier ]
Reconstruction de réseaux à partir de données génomiques et cliniques / Nadir Sella le 2019 [ Sorbonne université ]
Reconstruction de réseaux de gènes à partir de données d'expression par déconvolution centrée autour des hubs / Adel Ait-Hamlat le 2019 [ Sorbonne université ]
Synthesis of Boolean Networks from the Structure and Dynamics of Reaction Networks / Athénaïs Vaginay le 2023 [ Université de Lorraine ]
Approche combinée expérimentale et mathématique pour la personnalisation sur base moléculaire des thérapies anticancéreuses standards et chronomodulées / Annabelle Ballesta le 2011 [ Paris 11 ]
Étude des réseaux biologiques à grande échelle par modélisation statique et résolution des contraintes / Carito Guziolowski le 2010 [ Rennes 1 ]
Modélisation biogéochimique du système ”Irrigation-sol-plante-nappe” : Application à la durabilité du système de culture du foin de Crau / Gihan Mohammed le 2017 [ Avignon ]
Une approche de modélisation de biologie des systèmes sur la spondylarthrite / Emmanuel Chaplais le 2015 [ Versailles-St Quentin en Yvelines ]
Modélisation cinétique du métabolisme : construction du modèle, analyse et applications biotechnologiques / Adrien Henry le 2015 [ Sorbonne Paris Cité ]
Complétion combinatoire pour la reconstruction de réseaux métaboliques, et application au modèle des algues brunes Ectocarpus siliculosus / Sylvain Prigent le 2014 [ Rennes 1 ]
Modèles réduits et hybrides de réseaux de réactions biochimiques : applications à la modélisation du cycle cellulaire / Vincent Noël le 2012 [ Rennes 1 ]
Étude du rôle des NTIC sur la construction de connaissances scientifiques dans le domaine de la biologie : implication pour la didactique de la biologie en contexte numérique / Dorsaf Ben Ismail Ben Romdhane le 2011 [ Paris 8 ]
Bases creuses en algèbre linéaire exacte et simplification algorithmique de modèles biologiques / Alexandre Temperville le 2016 [ Lille 1 ]
Multi-scale modeling of hepatic drug toxicity and its consequences on ammonia detoxification / Géraldine Celliere le 2016 [ Sorbonne Paris Cité ]
Identification of new therapeutic targets for cystic fibrosis using systems biology and chemogenomics approaches / Matthieu Najm le 2023 [ Université Paris sciences et lettres ]
Étude de l'évolution des interactions moléculaires chez les Eucaryotes par des méthodes de comparaison de réseaux dans le but d'identifier des processus ancestraux partagés associés au vieillissement / Hugo Bonnefous le 2025 [ Sorbonne université ]
Dynamique d'un réseau métabolique avec un modèle à base de contraintes : approche par échantillonnage des trajectoires solutions / Thomas Duigou le 2015 [ Paris 11 ]
Applying Systems Biology and Multi-layered Profiling Towards a Comprehensive Understanding of Cell Aging / Jose Americo Nabuco Leva Ferreira de Freitas le 2020 [ Université Paris Cité ]
Machine learning and systems biology approaches to find therapeutic strategies in atip3-deficient triple negative breast cancer / Gwenn Guichaoua le 2025 [ Université Paris sciences et lettres ]
Causal network analysis of single cell multi-omics data applied to a cellular therapy against multiple sclerosis / Louise Dupuis le 2024 [ Sorbonne université ]
Mesures quasi-stationnaires et applications à la modélisation de l'évolution biologique / Aurélien Velleret le 2020 [ Aix-Marseille ]
Développement de méthodes évolutionnaires d'extraction de connaissance et application à des systèmes biologiques complexes / Benjamin Linard le 2012 [ Strasbourg ]
Subgraph Epimorphisms : Theory and Application to Model Reductions in Systems Biology / Steven Gay le 2015 [ Sorbonne Paris Cité ]
Integrative analysis and modeling of molecular pathways dysregulated in rheumatoid arthritis / Vidisha Singh le 2020 [ université Paris-Saclay ]
Analyse des voies métaboliques au cours du cycle cellulaire : application au métabolisme du cancer / Cécile Moulin le 2020 [ université Paris-Saclay ]
Logic programming tools for metabolic fluxes analysis and biological applications / Maxime Mahout le 2023 [ université Paris-Saclay ]
Step-wise target controllability of driver nodes in biological networks / Giulia Bassignana le 2020 [ Sorbonne université ]
Modélisation computationnelle de l’absorption intestinale du glucose pour la prédiction du diabète de Type 2 / Danilo Dursoniah le 2024 [ Université de Lille (2022-....) ]
Modélisation de phénomènes biologiques complexes : application à l'étude de la réponse antigénique de lymphocytes B sains et tumoraux / Nicolas Jung le 2014 [ Strasbourg ]
Correlation between lipopeptide biosynthesis and their precursor metabolism in Bacillus subtilis / Debarun Dhali le 2016 [ Lille 1 ]
Comparaison de différentes voies d’administration vaccinale et leur immunogénicité par une approche de biologie des systèmes / Eléna Gonçalves le 2020 [ Sorbonne université ]
Explorations Multi-omiques dans les maladies neuromusculaires / Ivana Dabaj le 2023 [ Normandie ]
The genotype-phenotype relationship across different scales / Henry Kemble le 2018 [ Sorbonne Paris Cité ]
Apport des sciences omiques dans la maladie de Fabry / Sarah Snanoudj-Verber le 2023 [ Normandie ]
Bioinformatic and modelling approaches for a system-level understanding of oxidative stress toxicity / Elias Zgheib le 2018 [ Compiègne ]
Evolving information in living systems : a pathway for the understanding of cooperation and other major transitions / Livio Riboli-Sasco le 2010 [ Paris 5 ]
Analyse des réseaux moléculaires impliqués dans le remodelage ventriculaire gauche post-infarctus du myocarde et dans l’insuffisance cardiaque / Marie Cuvelliez le 2019 [ Université de Lille (2018-2021) ]
Inférence logique de réseaux booléens à partir de connaissances et d'observations de processus de différenciation cellulaire / Stéphanie Chevalier le 2022 [ université Paris-Saclay ]
Nouvelles approches informatiques et mathématiques pour la résolution de problèmes biologiques / Mohamed Lemine Ahmed Sidi le 2022 [ Tours ]
Modélisation bioinformatique des réseaux de régulation génétique et métabolique : application à l'étude du comportement des cellules exposées au déficit en folates et à des contaminants alimentaires en cause dans la génèse du cancer / Etienne Gnimpieba Zohim le 2011 [ Compiègne ]
Biologie des systèmes et intelligence artificielle pour l'identification des réseaux de régulation de l'addiction oncogénique dans le cancer du poumon / Geoffrey Pawlak le 2025 [ Université de Lille (2022-....) ]