Note publique d'information : Au cours de ma thèse, je me suis intéressée au facteur de transcription TFIIS, un
facteur d'élongation de l'ARN polymérase II impliqué dans la stimulation de l'activité
de clivage intrinsèque de cette enzyme. L'étude de la localisation globale du facteur
TFIIS sur le génome de Saccharomyces cerevisiae par ChIP-on-chip a révélé que TFIIS,
en plus d'être présent sur les gènes de classe II (ie. transcrits par l'ARN polymérase
II), est également présent sur l'ensemble des transcrits de classe III (ie. transcrits
par l'ARN polymérase III), suggérant ainsi un rôle jusqu'alors inconnu de cette protéine
dans la transcription par l'ARN polymérase III. Des expériences de génomique, de génétique
et de biochimie nous ont permis de montrer que TFIIS est un facteur de transcription
de l'ARN polymérase III impliqué dans le choix du site d'initiation de la transcription.
Par la suite, j'ai souhaité poursuivre cette étude chez Mus musculus, afin de déterminer,
entre autres, si le rôle de TFIIS dans la transcription par l'ARN polymérase III est
conservé chez les eucaryotes pluricellulaires. Des expériences préliminaires révèlent
que Tcea1, l'une des isoformes de TFIIS chez M. musculus, serait présent sur quelques
gènes de classe II et III. Lors de ma thèse, j'ai également pris part à deux autres
projets en cours dans le laboratoire. L'un a porté sur le rôle du Médiateur, un complexe
multiprotéique coactivateur de la transcription par l'ARN polymérase II, dans la mise
en place du complexe de préinitiation via le recrutement du facteur TFIIH. Le second
projet a permis de montrer que l'ARN polymérase II agit comme un senseur de la disponibilité
en nucléosides triphosphates dans la cellule.
Note publique d'information : During my thesis I worked on the transcription factor TFIIS, which is responsible
for the stimulation of the cleavage activity of arrested RNA polymerase II (Pol II).
The genome-wide location analysis of TFIIS in Saccharomyces cerevisiae using ChIP-on-chip
experiments revealed that TFIIS is located on many Pol II-transcribed genes, but also
on all Pol III-transcribed genes, thus suggesting an unsuspected role of this protein
in Pol III transcription. Further in vivo and in vitro experiments allowed us to propose
that TFIIS is a Pol III transcription factor implicated in start site selection. I
then decided to pursue this study in Mus musculus, in order to determine if the role
of TFIIS in Pol III transcription is conserved in higher eukaryotes. Preliminary experiments
revealed that Tcea1, one of the TFIIS isoforms in M. musculus, is located on some
Pol II and Pol III transcribed genes. During my thesis, I have also been involved
in two other projects. One of them focused on the role of the Mediator, a multiprotein
coactivator complex of the RNA polymerase II, in the formation of the preinitiation
complex by recruiting the TFIIH factor. The other project allowed us to demonstrate
that the RNA polymerase II acts as a sensor of the nucleoside triphosphate availability
in the cell.