Identifiant pérenne de la notice : 246189665
Notice de type
Notice de regroupement
Note publique d'information : DANS LE CADRE DU PROJET DE SEQUENCAGE DU GENOME DE BACILLUS SUBTILIS, LA REGION SITUEE
ENTRE LES LOCI CYSB ET HISA A ETE ATTRIBUEE A NOTRE GROUPE. NOUS AVONS TESTE DIFFERENTES
STRATEGIES AFIN D'ISOLER CETTE ZONE D'INTERET: (I) MARCHE SUR LE CHROMOSOME PAR INTEGRATION
DE PLASMIDES, (II) INTEGRATION DE DEUX CASSETTES, PORTANT CHACUNE LE SITE DE RECONNAISSANCE
D'UNE MEGANUCLEASE (I-SCEL), POUR RECUPERER ENSUITE LE FRAGMENT DE RESTRICTION, ET
(III) UTILISATION D'UN YAC DE LA BANQUE GENOMIQUE ORDONNEE DE B. SUBTILIS. LE SEQUENCAGE
DE CE FRAGMENT (115 KB) A ETE ABORDE EN UTILISANT UNE STRATEGIE ELABOREE LORS DU SEQUENCAGE
D'UN FRAGMENT DE 13 KB (FABRET ET COLL., 1995). CETTE STRATEGIE REPOSE SUR UN SHOT-GUN
A FAIBLE TAUX DE COUVERTURE (2 A 3). LA PRISE EN COMPTE SYSTEMATIQUE DES SEQUENCES
DES DEUX EXTREMITES DE CHAQUE INSERT, ET DE LA DISTANCE LES SEPARANT, A CONDUIT A
LA CONSTRUCTION D'UNE CARTE PHYSIQUE PARTIELLE DES CONTIGS, TERMINEE A L'AIDE DE REACTIONS
DE PCR. LA DISPONIBILITE DE CETTE CARTE NOUS A PERMIS DE NOUS FOCALISER SUR DEUX REGIONS
PARTICULIERES DE 21 KB ET 12 KB, INTEGRALEMENT SEQUENCEES. L'ORGANISATION TRANSCRIPTIONNELLE
DE LA REGION DE 21 KB A ENSUITE ETE ETUDIEE AU MOYEN D'EXPERIENCES DE NORTHERN BLOT.
UNE ETUDE FONCTIONNELLE PAR INTERRUPTION GENIQUE A EGALEMENT COMMENCE, AVEC DES FUSIONS
TRANSCRIPTIONNELLES ENTRE LE GENE INTERROMPU ET LE GENE LACZ. LES PREMIERS RESULTATS
SONT DISPONIBLES POUR UN ORF, DONT LE PRODUIT SEMBLE IMPLIQUE DANS LA BIOSYNTHESE
D'UN POLYSACCHARIDE DE SURFACE. AUCUN TRANSCRIT CORRESPONDANT A CE GENE POTENTIEL
N'A ETE DETECTE DANS LES CONDITIONS CONSIDEREES, ET SON INTERRUPTION CONDUIT A UN
PHENOTYPE LISSE DES COLONIES. CE RESULTAT EST A METTRE EN PARALLELE AVEC L'IDENTIFICATION
DANS CETTE REGION DU CHROMOSOME D'UN LOCUS SMO, RESPONSABLE DE L'APPARENCE LISSE OU
RUGUEUSE DES COLONIES
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Documentation
