Identifiant pérenne de la notice : 247854794
Notice de type
Notice de regroupement
Note publique d'information : Le comportement conformationnel des glycannes, et donc leur flexibilite, peuvent influencer
directement la reactivite chimique et l'activite biologique de ces molecules. Dans
ce travail, la modelisation moleculaire d'une serie de glycannes de complexite croissante
a ete realisee en utilisant plusieurs methodes d'exploration de l'espace conformationnel,
dont la methode heuristique cicada, associees a differents champs de force : mm3 et
amber avec plusieurs parametrisations disponibles pour les glycannes. La validation
des modeles a ete apportee par des methodes theoriques de chimie quantique et des
methodes experimentales telles que la resonance magnetique nucleaire et la cristallographie
aux rayons x. Pour les monosaccharides, les comportements conformationnels de deux
cycles furanose ont ete etudies par plusieurs methodes et les resultats ont ete compares
aux structures cristallines connues. Les constantes de couplage #3j#h#-#h intracycliques
ont ete calculees et comparees aux donnees de rmn. Cette approche a permis de determiner
les conformations de plus basse energie ainsi que de demontrer la grande flexibilite
de ces systemes. Le comportement conformationnel de la liaison glycosidique a ete
etudie par modelisation moleculaire de deux disaccharides et d'un heptasaccharide.
Ces etudes ont demontre la capacite de la methode cicada a explorer des espaces conformationnels
tres complexes de facon rapide et efficace. Les donnees rmn et cristallographiques
ont confirme l'existence des modeles de plus basse energie. Afin d'etudier les interactions
proteine-glucide, un modele tridimensionnel d'un complexe entre la lectine de lathyrus
ochrus et un nonasaccharide biantenne et flucosyle a ete construit. Les comportements
conformationnels du nonasaccharide libre et complexe ont ete etablis en utilisant
les methodes conformationnelles validees sur les molecules plus petites. Les resultats
de la modelisation ont pu etre compares avec les donnees cristallographiques de plusieurs
complexes lectine/oligosaccharides. Les limites des methodes de modelisation moleculaire
utilisees dans cette etude sont discutees.
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Documentation
