Identifiant pérenne de la notice : 247855391
Notice de type
Notice de regroupement
Note publique d'information : CE TRAVAIL TRAITE DE DIVERS ASPECT DE LA METHODE HCA. PREMIEREMENT, NOUS AVONS EXPLORE,
PAR MODELISATION PAR HOMOLOGIE, LA COMPATIBILITE TRIDIMENSIONNELLE DE LA DIMERISATION
DU DOMAINE DE LIAISON A L'HORMONE DES RECEPTEURS NUCLEAIRES EN FONCTION D'UNE NOUVELLE
HYPOTHESE D'ALIGNEMENT HCA AVEC LA FAMILLE DES INHIBITEURS DE PROTEASE A SERINE. LES
MODELES CONSTRUITS SONT TRES BIEN ADAPTES A LA SOUS FAMILLE DES RECEPTEURS STEROIDIENS,
TANT AU NIVEAU DE LA FORMATION DES DIMERES QUE DE LA LOCALISATION DES SITES. POUR
LES RECEPTEURS STEROIDIENS, DEUX SITES COMPATIBLES AVEC LA GEOMETRIE DES MODELES ET
LES MARQUAGES D'AFFINITE PEUVENT ETRE PROPOSES. POUR LES RECEPTEURS NON STEROIDIENS,
LA LOCALISATION DE CERTAINES DONNEES EXPERIMENTALES SUR LE MODELE SUGGERE L'EXISTENCE
D'UNE INTERFACE DE DIMERISATION ALTERNATIVE. DEUXIEMEMENT NOUS AVONS DEVELOPPE DES
TECHNIQUES DESTINEES A AUTOMATISER L'ALIGNEMENT DE SEQUENCES PAR HCA. A CET EFFET
NOUS AMELIORONS LA CORRESPONDANCE ENTRE LES LIMITES DES CLUSTERS HYDROPHOBES ET LES
LIMITES DES STRUCTURES SECONDAIRES REGULIERES. NOUS AVONS EGALEMENT MIS AU POINT UN
CODAGE DE SEGMENTS DE SEQUENCE, SOUS FORME DE VECTEURS, UTILISANT L'AUTOCORRELATION
DES PROFILS DE SIMILARITE PAR RAPPORT AUX DIFFERENTS TYPES D'ACIDES AMINES. CE CODAGE
EST EVALUE PAR SON APTITUDE A CLASSER LES SEGMENTS, SUR UNE CARTE TOPOLOGIQUE DE KOHONEN,
EN FONCTION DE LEUR STRUCTURATION SECONDAIRE. FINALEMENT NOUS ALIGNONS, PAR PROGRAMMATION
DYNAMIQUE, DES SEQUENCES DE VECTEURS CORRESPONDANT AUX SEGMENTS DELIMITES PAR LES
LIMITES DES STRUCTURES SECONDAIRES VRAIES OU PAR LES LIMITES DES CLUSTERS HCA
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