Identifiant pérenne de la notice : 256413169
Notice de type
Notice de regroupement
Note publique d'information : Un plan de synthèse est, pour une molécule donnée, une séquence de réactions permettant
de la produire à partir de molécules commercialisées ou facilement synthétisables.
En chémoinformatique, prédire ou aider à la conception de plans de synthèse pour de
nouvelles molécules est un défi. Cela consiste à analyser les très grandes bases de
données de réactions moléculaires existantes pour construire de nouveaux plans de
synthèse à partir de plans existants pour des molécules similaires. Dans ce contexte,
la similarité entre molécules repose sur la topologie.Nous introduisons une représentation
structurelle des molécules appelée graphe de cycles. Cette représentation est basée
sur les cycles du graphe moléculaire et leurs interconnexions.Cette représentation
canonique permet de définir une mesure de similarité entre les structures de molécules.
Elle nécessite un temps de calcul raisonnable. Nos études montrent qu’elle est plus
adaptée pour les travaux sur les plans de synthèse que les autres mesures de similarité
existantes.À partir des graphes des cycles, nous proposons une classification des
réactions en fonction des effets sur la structure des molécules. Il s'agit de la première
étape pour la prédiction des plans de synthèse.
Note publique d'information : A synthesis pathway is, for a given molecule, a sequence of reactions making possible
to obtain it from purchasable molecules or easily synthesizable. In chemoinformatics,
predicting or assisting the conception of synthesis pathways for new molecules is
a challenge. It consists in analyzing the very large databases of existing molecular
reactions to build new synthesis pathways from existing plans of similar molecules.
In this context, the similarity between molecules relies on their topology.We introduce
a structural representation of molecules called the graph of cycles. This representation
is based on the cycles in the molecular graph and their interconnections.This representation
is canonical and allows us to define a similarity measure between structures of molecules
and is computable in a reasonable amount of time. Our studies show that it is more
adapted for works on synthesis pathways than the other existing similarity measures.Based
on the graph of cycles, we proposed a classification of reactions according to the
effects on the structure of molecules. This is the first step for the prediction of
synthesis pathways.
paprika.idref.fr
data.idref.fr
Documentation
